Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP4Q9H6H4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP4Q9H6H4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms