Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NXF3Q9H4D5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms