Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF39Q9H2S5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF39Q9H2S5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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