Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL3Q9H2J4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms