Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHD4Q9H223 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EHD4Q9H223 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms