Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPH9Q9H1X1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RSPH9Q9H1X1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms