Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIL1Q9H173 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SIL1Q9H173 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms