Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ9H0N0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ9H0N0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ9H0N0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ9H0N0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB6CQ9H0N0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ9H0N0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms