Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN2Q9H000 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN2Q9H000 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms