Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF3Q9GZM5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms