Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC27Q9C0I9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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