Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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