Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER1Q9C0I3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER1Q9C0I3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms