Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM7Q9C029 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms