Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEB1Q9BZB8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEB1Q9BZB8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms