Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SETD2Q9BYW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SETD2Q9BYW2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms