Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP3-1Q9BYR8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms