Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIFKQ9BYG3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIFKQ9BYG3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms