Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC8Q9BY41 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC8Q9BY41 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC8Q9BY41 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms