Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RNF17Q9BXT8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RNF17Q9BXT8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms