Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL25A1Q9BXS0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms