Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA5Q9BWX5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATA5Q9BWX5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms