Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF2Q9BWQ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms