Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFJQ9BTM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms