Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms