Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C16orf70Q9BSU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C16orf70Q9BSU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms