Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM175Q9BSA9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM175Q9BSA9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms