Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF649Q9BS31 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms