Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP44Q9BS26 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP44Q9BS26 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 501.8 ms