Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM56Q9BRZ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM56Q9BRZ2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM56Q9BRZ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM56Q9BRZ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM56Q9BRZ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM56Q9BRZ2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM56Q9BRZ2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM56Q9BRZ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM56Q9BRZ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms