Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms