Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF8Q9BRL6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms