Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REEP2Q9BRK0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms