Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BPIFA3Q9BQP9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA3Q9BQP9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms