Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT3Q9BQG1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms