Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS8Q99627 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPS8Q99627 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS8Q99627 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms