Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGMNQ99538 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms