Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YME1L1Q96TA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms