Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPXM1Q96SM3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPXM1Q96SM3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPXM1Q96SM3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPXM1Q96SM3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms