Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN18Q96SJ8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN18Q96SJ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms