Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNT1Q96Q11 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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