Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms