Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC3BQ96NL0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms