Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD6Q96NK8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD6Q96NK8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms