Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP4Q96MN2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms