Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms