Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74BQ96LY2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74BQ96LY2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74BQ96LY2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms