Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRIMPOLQ96LW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRIMPOLQ96LW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms