Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms