Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPTM1LQ96KA5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPTM1LQ96KA5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPTM1LQ96KA5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms