Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COG3Q96JB2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG3Q96JB2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms